A Minimal Book Example
1
Metabolomics Data Analysis
2
install MNet package
3
数据前处理
3.1
代谢物鉴定
3.2
代谢物名称统一
3.3
批次矫正
3.3.1
data for SERRF
3.3.2
对SERRF校正前后的数据进行PCA分析
3.3.3
data filter
4
差异代谢物
4.1
PCA
4.2
limma
4.3
OPLS-DA
4.4
可视化
4.4.1
Heatmap
4.4.2
Volcano Plot
4.4.3
Z-score
5
Pathway分析
5.1
Pathway Enrichment Analysis
5.2
Differential Abundance Analysis
5.3
MSEA
Published with bookdown
生信分析系列培训课程(第2期)
生信分析系列培训课程(第2期)
Tuantuan Gui and Xuan Liu
2023-11-23
Chapter 1
Metabolomics Data Analysis
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